Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRADDQ15628 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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