Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1AQ15573 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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