Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms