Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAM2Q15035 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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