Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
R3HDM1Q15032 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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