Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA3AQ14563 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms