Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCARB2Q14108 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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