Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX2Q13950 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms