Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE7AQ13946 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms