Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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