Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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ITGA9Q13797 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA9Q13797 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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