Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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TUBA3CQ13748 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TUBA3CQ13748 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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