Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA1SQ13698 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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