Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTCH1Q13635 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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