Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL1Q13616 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms