Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNW1Q13573 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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