Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC1Q13547 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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