Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PICALMQ13492 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PICALMQ13492 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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