Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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UBE2V1Q13404 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
UBE2V1Q13404 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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