Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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