Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRSF6Q13247 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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