Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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