Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms