Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FOXC1Q12948 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXC1Q12948 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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