Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRJQ12913 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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