Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TP53BP1Q12888 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TP53BP1Q12888 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TP53BP1Q12888 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms