Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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