Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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