Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CGNL1Q0VF96 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms