Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYCNQ0VAF6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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