Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms