Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NCBP1Q09161 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCBP1Q09161 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms