Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C2orf54Q08AI8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms