Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL9Q07325 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CXCL9Q07325 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms