Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms