Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXOSC9Q06265 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC9Q06265 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms