Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN11Q06124 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms