Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms