Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms