Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms