Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACVR1Q04771 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms