Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCNT1Q02742 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCNT1Q02742 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms