Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms