Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms