Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDC42EP1Q00587 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms