Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PITX1P78337 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PITX1P78337 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PITX1P78337 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITX1P78337 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITX1P78337 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms