Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBBP68871 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBBP68871 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HBBP68871 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms