Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms