Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms