Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRPF1P55201 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms